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1950
- 1955. 11. 17
  경상북도 위생시험소(도조례 제9호) 관리담당, 세균담당
1970
- 1975. 12. 31
  보건연구소법 제정(법률 제2858호)
  서무계, 위생화화계, 세균혈청계 정원 27명
- 1976. 10. 20
  경상북도보건연구소로개칭(도조례 제788호)
  서무계, 미생물과, 약품분석과, 공해과 정원 32명
1980
- 1987. 12. 31
  경상북도 보건환경연구소로 개칭 및 직제 확대 개편
  5과 1계에서 총무과, 보건연구부, 환경연구부로(도조례 제 1702호)
  환경연구부에 환경조사과와 폐기물분석과 신설
  정원 34명에서 54명으로 증원(도규칙 제1613호)
1990
- 1991.01. 23
  경상북도지방공무원정원규칙 개정(도규칙 제1840호)
  정원 56명에서 59명으로 증원, 역학조사과 신설
- 1991.05. 10
  경상북도 보건환경연구원으로 개칭 수질검사과 신설, 정원 59명에서 68명으로 증원(도규칙 제1861호)
- 1995.03. 02
  사업소에서 직속기관으로 승격(도조례 제2308호)
- 1997.12. 31
  경상북도보건환경연구원설치 및 운영조례 개정(도조례 제2468호)
  북부지원 설치
- 1998.11. 19
  도 조직개편으로 보건연구부, 환경연구부 통합 연구부로 직제개편
- 1998.07. 12
  경상북도보건환경연구원 운영조례 개정(제2577호)
- 1998.08. 30
  경상북도지방공무원정원규칙 개정(도규칙 제2366호)
  정원 83명에서 81명으로 조정, 科(과)에서 팀으로 조정
2000
- 2000.07. 31
  경상북도지방공무원정원규칙 개정(도규칙 제2387호)
  정원 81명에서 79명으로 조정, 팀에서 科(과)로 조정
- 2001.08. 01
  경상북도지방공무원정원규칙 개정(도규칙 제2418호)
  정원 79명에서 78명으로 조정
- 2003.03. 27
  경상북도지방공무원정원규칙 개정(도규칙 제2451호)
  정원 78명에서 81명으로 조정
- 2008.09. 22
  현 청사 이전(영천시 금호읍 원제리)
  경상북도 행정기구 설치조례 시행규칙 개정(도규칙 제2600호)
  북부지원 환경분석과 신설
- 2009.02.16
  경상북도 지방공무원 정원배정 및 세부분장사무에 관한 규정개정(도훈령 제1316호)
  정원 80명에서 81명으로 조정
- 2009.09. 21
  경상북도 행정기구 설치조례 시행규칙 개정(도규칙 제2632호)
  북부지원 음용수과 신설, 정원 82명
2010
- 2011.01. 03
  경상북도 행정기구 설치조례 시행규칙 개정(도규칙 제2677호)
  질병조사과 신설, 정원 82명
- 2014.10.
  경상북도 행정기구 설치조례 시행규칙 개정(도규칙 제2788호)
  생활환경과 신설
- 2015.05. 21
  경상북도 지방공무원 정원배정 및 세부분장사무에 관한 규정개정(도 훈령 제1460호)
  정원83명에서 86명으로 조정
- 2016.02
  경상북도 행정기구설치조례 시행규칙 재정(도규칙 제 2830호)
  농수산물검사과 신설 정원 86명
- 2017.03
  경상북도 행정기구설치조례 시행규칙 개정(도규칙 제 2859호)
  감염병조사과 신설 정원 90명
- 2019.07. 11
  경상북도 행정기구설치조례 시행규칙 개정 (도규칙 제 2929호)
  포항농수산물검사소 신설
2020
- 2023.01. 01
  보건연구부에서 감염병연구부, 식의약연구부로 部 분리

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